2016年解码功能基因组暨基因编辑技术，长非编码RNA，表观遗传学实操班

•       随着分子生物学技术和生物信息学的发展，功能基因组学的研究已成为基因组学中引人注目的新方向和研究热点。利用结构基因组学提供的信息和产物，通过在基因组或系统水平上全面分析基因的功能，使生物学研究从单一基因或蛋白质的研究转向对多个基因或蛋白质同时进行系统的研究。“智能信息处理技术”为人力资源与社会保障部中国科学院北京分院国家级专业技术人员继续教育基地培训点培训项目，“生物信息”为智能信息处理技术系列培训项目之一。为进一步推动我国生物信息学的发展，提高从业人员的技术水平，北京海淀中科计算技术转移中心（中科院计算所技术转移中心）举办“生物信息学最新技术 暨 解码基因组功能原理与方法”高级培训班，并由北京嘉诚永恒科技有限公司具体承办，具体事宜通知如下：

一、培训目标及特点：

• 本培训立足于最新技术和工具，强调融会贯通、综合应用。采用“互动式教学，讨论式授课，案例式学习”的教学模式。培训邀请的主讲人均是有理论和实际研究经验的人员。学员通过与专家直接交流，能够分享到这些顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。学员通过集中专题学习后能够扩展思路，在研究技术方面领悟更多。

二、培训对象：

• 大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、农学、检验检疫等专业的课程负责人、一线教师、教研室骨干人员、教学管理人员；科研单位从事生物、生命科学、微生物研究、食品质量控制、医药研究的相关人员；生物、医药、检验检疫及相关企业的领导与技术骨干。

三、时间地点：2016年6月2日——6月5日   西 安

（时间安排：第1天报到，授课3天）

四、报名办法及费用： 

• 每人￥4300元（含报名费、培训费、资料费），住宿可统一安排，费用自理。请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加培训，各单位也可直接报名参加，报名回执表请传真至会务处。

五、主讲专家：

• 主讲专家来自中科院等科研机构的高级专家，拥有丰富的科研及工程技术经验，长期从事生物信息领域项目研究，具有资深的技术底蕴和专业背景。

六、颁发证书：

学员经培训考试合格后可以获得：

• 1．由人力资源和社会保障部中国高级公务员培训中心、全国信息化计算机技术水平教育培训管理中心颁发的《生物信息工程师技术水平教育培训》证书，证书可在人保部中国国家人事人才培训网查询（http://www.chinanet.gov.cn），可作为能力评价、考核和任职的重要依据。

2．由北京海淀中科计算技术转移中心颁发的《生物信息工程师》培训证书。

注：请学员带两寸彩照2张（背面注明姓名）、身份证复印件一张。

一 、DNA测序技术-原理及技术

a)第二代测序技术：Illumina，454, Ion Torrent原理

b)第三代测序技术：PacBio, Hellicos原理

c)第四代测序技术：Oxford NanoPore原理

d)Hybridization based methods

e)测序技术的比较及展望 

二、基因组编辑技术（CRIPR技术）

a)不同基因组编辑技术的比较Meganuclease，ZFN，TALEN，           

b)CRISPR-Cas9

c)CRISPR-Cas系统的作用机理

d)CRISPR-Cas系统在基因组编辑中的应用

e)CRISPR-Cas系统的其他应用

三、生物信息学基本实验技能

a)Linux常用命令 

b)EMBOSS，经典序列分析工具集

c)Perl编程基础

四、小RNA（microRNA）研究方法及案例

a)实验流程

b)数据处理比对

c)靶基因富集分析

d )miRNA-mRNA关联分析

e)主要工具包的使用：miRDeep，mirDeep*

五、长非编码RNA（lncRNA）研究方法及案例

a)实验流程

b)lncRNA的发现和分类

c) 功能分类

d)主要工具包的使用：lncRScan，LncRNAFunction等 

六、表观遗传学研究方法及案例

a ) DNA methylation, MeDIP-seq

b ) Histone modifications, ChIP-seq, ChIP-exo

c ) Nucleosoem positioning and occupancy, MNase-seq

d ) Chromatin accessibility, DNase-seq

e ) 3D chromatin structure, 3C, 4C, 5C, Hi-C

七、基于DNA/RNA测序技术的功能基因组学研究策略分析

a ) ARNA Transcription: ChIRP-Seq, GRO-Seq, Ribo-Seq, CLIP-Seq

b ) RNA structure: SHAPE-Seq, PARS-Seq, FRAG-Seq, CAP-seq

c ) Low-level RNA detection: Quartz-Seq, DP-Seq, Smart-Seq, d 

d ) Smart-Seq2

e ) Low-level DNA detection: smMIP, MDA, MALBAC, OS-Seq

八、R语言基础

a ) R和R studio的安装

b ) 从bioconductor下载安装packages

c ) R绘图基础，correlation matrix ,dot plot